Provinsi Kalimantan Timur dan Papua menjadi provinsi kedua  yang paling banyak mengirimkan wakilnya di Liga 1 2018. Di Kalimantan Timur, tercatat terdapat dua klub yang berpartisipasi, yaitu Borneo FC dan Mitra Kukar. 

Kedua tim relatif baru. Meski begitu, khusus untuk Borneo FC, mereka memiliki basis suporter yang besar dan loyal karena dahulunya berasal dari 2 klub tua yang sebelumnya pernah terbentuk di Samarinda, yaitu Persisam samarinda dan Putra Samarinda. 

Sementara itu di Papua, terdapat dua klub tradisionil yaitu Persipura Jayapura dan Perseru Serui. Persipura sendiri merupakan tim yang paling banyak menjuarai Liga Indonesia. Sementara Perseru dalam beberapa musim terakhir mampu berada di kasta teratas sepakbola Indonesia.